Sآستاگزانتین مصنوعی و آستاگزانتین طبیعی هستندمتفاوت استtظرفیت آنتی اکسیدانی آنها و محتوای و خلوص آستاگزانتین متفاوت است و از نظر ساختار متفاوت است. بنابراین، تفاوت هایی نیز در اثربخشی وعملکرد.

Sمصنوعی :
آستاگزانتین را می توان به صورت شیمیایی از کاروتن تهیه کرد. این منبع اصلی آستاگزانتین در خوراک ماهی است. دو روش افزودن استخراج ضایعات میگو یا استخراج مخمر تولید کننده آستاگزانتین گران تر هستند، به همین دلیل است که روش سنتز شیمیایی بیشتر مورد استفاده قرار می گیرد.
علاوه بر روشهای سنتز شیمیایی مصنوعی، به طور کلی سه منبع بیولوژیکی آستاگزانتین طبیعی وجود دارد: زبالههای صنعت فرآوری محصولات آبزی، فافیا رودوزیما و ریزجلبکها (Haematococcus pluvialis). در میان آنها، محتوای آستاگزانتین در زباله کم است و هزینه استخراج بالا است که برای تولید در مقیاس بزرگ مناسب نیست. میانگین محتوای آستاگزانتین در فافیا رودوزیما طبیعی تنها 0.40٪ است. در مقابل، محتوای آستاگزانتین در Haematococcus pluvialis به اندازه 5٪ است، بنابراین به عنوان یک"کنسانتره" در نظر گرفته می شود. آستاگزانتین طبیعی
تفاوت بین آستاگزانتین مصنوعی و آستاگزانتین طبیعی چیست؟
در حال حاضر تولید آستاگزانتین دو روش دارد: سنتز مصنوعی و اکتساب بیولوژیکی. آستاگزانتین مصنوعی نه تنها گران است، بلکه از نظر ساختار، عملکرد، کاربرد و ایمنی تفاوت های قابل توجهی با آستاگزانتین طبیعی دارد.

از نظر ساختار:
به دلیل چرخش نوری هیدروکسیل (-oh) در هر دو انتها، آستاگزانتین دارای 3 ایزومر است: 3s-3's، 3r-3's، و 3r-3'r (همچنین به آن چپ چرخشی، راسمیک، راست چرخشی نیز گفته می شود)tبله، آستاگزانتین مصنوعی مخلوطی از 3 ساختار آستاگزانتین است (25٪ برای چرخش چپ، 25٪ برای چرخش دکسترو، و حدود 50٪ برای راسمی شدن)،ازفعالیت آنتی اکسیدانی کم، آستاگزانتین مشتق شده از مخمر 100% دکستروچر است (3r-3'r) و دارای فعالیت آنتی اکسیدانی جزئی است. دو منبع فوق آستاگزانتین عمدتاً برای رنگ آمیزی حیوانات غیر غذایی استفاده می شود مثل ماهی های خانگی. فقط آستاگزانتین از جلبک ها به دست می آیدهماتوکوکوس پلویالیس، دارای ساختار 100% چرخشی (3s-3's) و قوی ترین فعالیت بیولوژیکی است.
Pعملکردهای هیزیولوژیکی:
پایداری و فعالیت آنتی اکسیدانی آستاگزانتین مصنوعی نیز کمتر از آستاگزانتین طبیعی است. از آنجایی که گروه های هیدروکسیل (-oh) در هر دو انتهای مولکول آستاگزانتین را می توان استری کرد، پایداری آن متفاوت است. بیش از 90 درصد آستاگزانتین طبیعی به شکل استری وجود دارد، بنابراین نسبتاً پایدار است. آستاگزانتین مصنوعی در حالت آزاد وجود دارد، بنابراین پایدار است. آستاگزانتین مصنوعی فقط حدود 1/4 ساختار چپ دست را دارد. یعنی فقط یک چهارمآنتی اکسیدان.
از نظر اثرات کاربردی:
جذب زیستی آستاگزانتین مصنوعی نیز بدتر از آستاگزانتین طبیعی است. تغذیهدر پایینغلظت، غلظتمصنوعیآستاگزانتین موجود در خون ماهی قزل آلای رنگین کمان به طور قابل توجهی کمتر از آستاگزانتین طبیعی است و نمی توان آن را به یک پیکربندی طبیعی در بدن تبدیل کرد. نه نه توانایی رنگ دهی و قدرت بیولوژیکی آن بسیار کمتر از آستاگزانتین طبیعی با همان غلظت است.
از نظر ایمنی زیستی:
در طول مصنوعیآستاگزانتینروند،به ناچار مواد شیمیایی ناخالصی را معرفی خواهد کرد مانند محصولات جانبی غیر طبیعی تولید شده,که ایمنی فراهمی زیستی آن را کاهش می دهد. با ظهور آستاگزانتین طبیعی، مدیریتروی مصنوعیآستاگزانتین در کشورهای سراسر جهان تبدیل شده استبه طور فزاینده ایسختگیرانه به عنوان مثال، سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) آستاگزانتین سنتز شده شیمیایی را از ورود به بازار مواد غذایی و مکمل های غذایی (مکمل ها) ممنوع کرده است، و آستاگزانتین طبیعی گواهینامه ایمنی عمومی (GRAS) را از FDA دریافت کرده است که می تواند به طور قانونی وارد غذا شود. بازار مکمل های غذایی تولید آستاگزانتین به طور کلی تمایل به ایجاد یک منبع بیولوژیکی از آستاگزانتین طبیعی دارد و بنابراین تولید در مقیاس بزرگ را انجام می دهد.
